Description
Within this work we address the relevance of integrating molecular techniques; particularly environmental DNA (eDNA) methods into biological monitoring programs. We focused on the Sebastes genus; a group of important fish in the Pacific Northwest of North America. They are particularly interesting from an evolutionary standpoint due to a high degree of interspecific sequence conservation paired with a high degree of intraspecific sequence variability. We used a novel whole mitochondrial genome approach to overcome these challenges and create successful targeted qPCR eDNA assays for species of particular importance. We also used a metabarcoding approach to compare molecular community diversity estimates with those made by conventional diving methods. We found that molecular techniques were highly sensitive and could detect more species overall. However, both molecular and conventional methods have their strengths. In terms of species and habitat protection, using multiple techniques together will be most impactful.
This data was collected in the territory of the Kitasoo/X'ais x'ais First Nation with the logistical support and permission of the Kitasoo/X'ais x'ais Stewardship Authority. If you download or use this data for any purpose please contact Christina Service the Wildlife Biologist and Science Coordinator at research@kxsa.ca.
[This dataset was processed using the GBIF eDNA converter tool.]
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 1 211 enregistrements.
1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Helbing C, Acharya-Patel N, Groenwold E, A. Lemay M, Clemente - Carvalho R, Morien E, Dudas S, Rubidge E, Lingyu Yang C, Coombe L, Warren R, Birol I, Frid A (2024). Comparison of Environmental DNA and SCUBA Diving Methods to Survey Keystone Rockfish Species on the Central Coast of British Columbia, Canada. Version 1.1. University of Victoria. Occurrence dataset. https://doi.org/10.5886/ekxjiu
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est University of Victoria. En vertu de la loi, l'éditeur a abandonné ses droits par rapport à ces données et les a dédié au Domaine Public (CC0 1.0). Les utilisateurs peuvent copier, modifier, distribuer et utiliser ces travaux, incluant des utilisations commerciales, sans aucune restriction.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a. University of Victoria publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Canada Biodiversity Information Facility.
Mots-clé
Occurrence
Contacts
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
https://orcid.org/0000-0002-8861-1070
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- Personne De Contact
Couverture géographique
British Columbia, Canada
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [52,43, -129,45], Nord Est [52,84, -127,96] |
|---|
Couverture taxonomique
N/A
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Class | Actinopterygii |
| Order | Scorpaeniformes |
| Family | Sebastidae |
Métadonnées additionnelles
| Identifiants alternatifs | 10.5886/ekxjiu |
|---|---|
| d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a | |
| https://data.canadensys.net/ipt/resource?r=edna-rockfish-uvic |