Descrição
Within this work we address the relevance of integrating molecular techniques; particularly environmental DNA (eDNA) methods into biological monitoring programs. We focused on the Sebastes genus; a group of important fish in the Pacific Northwest of North America. They are particularly interesting from an evolutionary standpoint due to a high degree of interspecific sequence conservation paired with a high degree of intraspecific sequence variability. We used a novel whole mitochondrial genome approach to overcome these challenges and create successful targeted qPCR eDNA assays for species of particular importance. We also used a metabarcoding approach to compare molecular community diversity estimates with those made by conventional diving methods. We found that molecular techniques were highly sensitive and could detect more species overall. However, both molecular and conventional methods have their strengths. In terms of species and habitat protection, using multiple techniques together will be most impactful.
This data was collected in the territory of the Kitasoo/X'ais x'ais First Nation with the logistical support and permission of the Kitasoo/X'ais x'ais Stewardship Authority. If you download or use this data for any purpose please contact Christina Service the Wildlife Biologist and Science Coordinator at research@kxsa.ca.
[This dataset was processed using the GBIF eDNA converter tool.]
Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 1.211 registros.
Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versões
A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.
Como citar
Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:
Helbing C, Acharya-Patel N, Groenwold E, A. Lemay M, Clemente - Carvalho R, Morien E, Dudas S, Rubidge E, Lingyu Yang C, Coombe L, Warren R, Birol I, Frid A (2024). Comparison of Environmental DNA and SCUBA Diving Methods to Survey Keystone Rockfish Species on the Central Coast of British Columbia, Canada. Version 1.1. University of Victoria. Occurrence dataset. https://doi.org/10.5886/ekxjiu
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é University of Victoria. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a. University of Victoria publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Canada Biodiversity Information Facility.
Palavras-chave
Occurrence
Contatos
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https://orcid.org/0000-0002-8861-1070
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Cobertura Geográfica
British Columbia, Canada
| Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [52,43, -129,45], Norte Leste [52,84, -127,96] |
|---|
Cobertura Taxonômica
N/A
| Reino | Animalia |
|---|---|
| Filo | Chordata |
| Class | Actinopterygii |
| Ordem | Scorpaeniformes |
| Família | Sebastidae |
Metadados Adicionais
| Identificadores alternativos | 10.5886/ekxjiu |
|---|---|
| d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a | |
| https://data.canadensys.net/ipt/resource?r=edna-rockfish-uvic |