Описание
Within this work we address the relevance of integrating molecular techniques; particularly environmental DNA (eDNA) methods into biological monitoring programs. We focused on the Sebastes genus; a group of important fish in the Pacific Northwest of North America. They are particularly interesting from an evolutionary standpoint due to a high degree of interspecific sequence conservation paired with a high degree of intraspecific sequence variability. We used a novel whole mitochondrial genome approach to overcome these challenges and create successful targeted qPCR eDNA assays for species of particular importance. We also used a metabarcoding approach to compare molecular community diversity estimates with those made by conventional diving methods. We found that molecular techniques were highly sensitive and could detect more species overall. However, both molecular and conventional methods have their strengths. In terms of species and habitat protection, using multiple techniques together will be most impactful.
This data was collected in the territory of the Kitasoo/X'ais x'ais First Nation with the logistical support and permission of the Kitasoo/X'ais x'ais Stewardship Authority. If you download or use this data for any purpose please contact Christina Service the Wildlife Biologist and Science Coordinator at research@kxsa.ca.
[This dataset was processed using the GBIF eDNA converter tool.]
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 1 211 записей.
Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Helbing C, Acharya-Patel N, Groenwold E, A. Lemay M, Clemente - Carvalho R, Morien E, Dudas S, Rubidge E, Lingyu Yang C, Coombe L, Warren R, Birol I, Frid A (2024). Comparison of Environmental DNA and SCUBA Diving Methods to Survey Keystone Rockfish Species on the Central Coast of British Columbia, Canada. Version 1.1. University of Victoria. Occurrence dataset. https://doi.org/10.5886/ekxjiu
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является University of Victoria. Насколько это возможно по закону, издатель отказался от всех прав на эти данные и посвятил их Public Domain (CC0 1.0). Пользователи могут без ограничений копировать, изменять, распространять и использовать работу, в том числе в коммерческих целях.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a. University of Victoria отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Canada Biodiversity Information Facility.
Ключевые слова
Occurrence
Контакты
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
https://orcid.org/0000-0002-8861-1070
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
- Originator ●
- Point Of Contact
Географический охват
British Columbia, Canada
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [52,43, -129,45], Север Восток [52,84, -127,96] |
|---|
Таксономический охват
N/A
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Class | Actinopterygii |
| Order | Scorpaeniformes |
| Family | Sebastidae |
Дополнительные метаданные
| Альтернативные идентификаторы | 10.5886/ekxjiu |
|---|---|
| d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a | |
| https://data.canadensys.net/ipt/resource?r=edna-rockfish-uvic |