説明
Within this work we address the relevance of integrating molecular techniques; particularly environmental DNA (eDNA) methods into biological monitoring programs. We focused on the Sebastes genus; a group of important fish in the Pacific Northwest of North America. They are particularly interesting from an evolutionary standpoint due to a high degree of interspecific sequence conservation paired with a high degree of intraspecific sequence variability. We used a novel whole mitochondrial genome approach to overcome these challenges and create successful targeted qPCR eDNA assays for species of particular importance. We also used a metabarcoding approach to compare molecular community diversity estimates with those made by conventional diving methods. We found that molecular techniques were highly sensitive and could detect more species overall. However, both molecular and conventional methods have their strengths. In terms of species and habitat protection, using multiple techniques together will be most impactful.
This data was collected in the territory of the Kitasoo/X'ais x'ais First Nation with the logistical support and permission of the Kitasoo/X'ais x'ais Stewardship Authority. If you download or use this data for any purpose please contact Christina Service the Wildlife Biologist and Science Coordinator at research@kxsa.ca.
[This dataset was processed using the GBIF eDNA converter tool.]
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、1,211 レコードが含まれています。
拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Helbing C, Acharya-Patel N, Groenwold E, A. Lemay M, Clemente - Carvalho R, Morien E, Dudas S, Rubidge E, Lingyu Yang C, Coombe L, Warren R, Birol I, Frid A (2024). Comparison of Environmental DNA and SCUBA Diving Methods to Survey Keystone Rockfish Species on the Central Coast of British Columbia, Canada. Version 1.1. University of Victoria. Occurrence dataset. https://doi.org/10.5886/ekxjiu
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は University of Victoria。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4aが割り当てられています。 Canada Biodiversity Information Facility によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversity of Victoria が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence
連絡先
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
https://orcid.org/0000-0002-8861-1070
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
地理的範囲
British Columbia, Canada
| 座標（緯度経度） | 南 西 [52.43, -129.45], 北 東 [52.84, -127.96] |
|---|
生物分類学的範囲
N/A
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Class | Actinopterygii |
| Order | Scorpaeniformes |
| Family | Sebastidae |
追加のメタデータ
| 代替識別子 | 10.5886/ekxjiu |
|---|---|
| d90cfe48-fe51-4206-b29d-f4c5cb67fa4a | |
| https://data.canadensys.net/ipt/resource?r=edna-rockfish-uvic |